Ki tudnál szűrni egy rákot okozó mutációt?

Az oktatási tevékenység célja, hogy segítse a biológia iránt érdeklődő középiskolai tanulókat olyan mutációk keresésében, amelyeket potenciálisan rák kialakulásához vezethetnek, valós genomikai adatok használatával. Az eljárás valójában nem kísérleti, ezért nincs szükség hozzá laboratóriumi felszerelésre. Ehelyett, a keresés elméleti alapon zajlik hiteles adatok használatával. Minden szükséges anyag amire a tevékenység során szükséged lesz, részletes utasításokkal együtt ingyenesen letölthető a program honlapjáról. Eltekintve attól, hogy ismertetnénk a tevékenység változatos lépéseit, a cikkben és a támogató honlapon találhatók fontos információk a rákos megbetegedésekkel kapcsolatban, mi okozza ezeket, hogyan alakulnak ki és hogyan használható a genomikai információ a kezelésük fejlesztése céljából. Ezentúlmenően számos vitapontot javasolnak arra, hogy diákjaink minél jobban megértsék a rákos betegségeket. A tevékenység bemutatása: A Nyomozzunk a rák után (Investigating Cancer) bemutató (elérhető online) áttekintést nyújt a diákok számára a rákról. Bemutatja a rák kialakulásához vezető abnormális DNS szekvencia változásokat, megmagyarázza a különböző okait ezeknek a mutációknak és bemutatja a feladatlapokat és a tevékenységet. A bemutatónak számos része buzdítja megbeszélésre a diákokat (lásd a bemutató feljegyzéseket). A tevékenység első részében a diákok azonosítanak eltéréseket a KRAS gén szekvenciájában egészséges és daganatos sejtek esetében a munkalapjukon és ezeket jelölik a KRAS transzparensen vagy a gén lapon is. A munkalapokon nyers KRAS DNS szekvencia részletek találhatók, amelyek egészséges és rákos sejtek mintájából származnak, eltérő, színes vonalakkal jelölve a génnek minden régiójában. A négy bázist minden területen négy eltérő színnel jelöltük. Minden színes csúcs egy önálló DNS bázist jelöl: Piros: T; Zöld: A; Kék: C; Fekete: G (normálisan ez a csúcs sárga színű lenne, de az nem olvasható könnyen a papíron) Összesen 11 számozott munkalap található, mindegyiken a KRAS gén két eltérő régiója található. Az a hat mutáció, ami a KRAS génen található, az első hat papíron van, ezért légy biztos benne, hogy jól összekeverted a papírokat, mielőtt kiosztod az osztálynak. Minden lapot meg kell csinálni, ahhoz hogy biztosan teljesen felfedezzétek a gén minden részét. Fontos, hogy a diákoknak rámutassunk arra, hogy ezek a mutációk (relatíve) ritkán fordulnak elő, ezért nem mindenki fog találni; abban is fontos szerepe van a feladatnak, hogy a diákok felfedezzék a negatív adat fontosságát és átfogó képet kapjanak a természettudományos tanulmányokról.

A tevékenység eredményeként a diákok egyszerű bázis szubsztitúciók (helyettesítések) tudnak azonosítani. Ezek a mutációk a KRAS gén protein-kódoló régióján a mutációk három típusának egyikeként osztályozhatók, a megváltozott kodonon kódolt információ alapján. Csendes mutáció, ha a kodon ugyanazt az aminosavat kódolja. Misszensz mutáció, ha a kodon más aminosavat kódol. Nonszensz mutáció, ha a kodon stop kodon, és ezért csonkává válik a fehérje.

A tevékenység az alábbi linken érhető el:

http://www.scienceinschool.org/hu/2010/issue16/cancer